神经药理学报 ›› 2020, Vol. 10 ›› Issue (6): 1-12.DOI: 10.3969/j.issn.2095-1396.2020.06.001
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尤斯涵,白景茹,王治宝,谭晓虹,郭春燕
YOU Si-han,BAI Jing-ru,WANG Zhi-bao,TAN Xiao-hong,GUO Chun-yan
摘要:
目的:通过网络药理学预测赤芍防治肝癌的作用机制。方法:通过 TCMSP 数据库(https://tcmspw. com/tcmspsearch.php)检索赤芍的化学成分,通过 STD 数据库以及 SEA 数据库预测赤芍的作用靶点。通过 OMIM 数据库(http://www.omim.org/)、DrugBank 数据库(https://www.drugbank.ca/)以及 TTD 数据库(http:// d b . i d r b l a b . n e t / t t d / ) 搜 集 肝 癌 疾 病 相 关 靶 点 ,筛 选 获 得 赤 芍 成 分 作 用 靶 点 与 肝 癌 疾 病 相 关 靶 点 交 集 ,利 用 S t r i n g 平台搜集相关靶点蛋白,借助 DAVID 数据库进行 Gene Ontology 注释分析,并通过 Cytoscape 3.2.1 软件构建蛋 白 - 蛋白相互作用网络,拓扑分析得到核心靶点,进一步分析赤芍防治肝癌作用机制。结果:从中药赤芍中筛选 得到 28 个化合物成分以及 442 个作用靶点,与 148 个肝癌相关靶点取交集得到 23 个共同靶点,靶点映射获得 22 个活性成分,蛋白 - 蛋白相互作用网络有 193 个节点,722 条边,经拓扑学指标筛选得到 95 个节点,439 条边, 核心靶点有 21 个。GO 注释得到 561 条生物过程,85 条细胞组分以及 130 条分子功能的信息。结论:网络药理 学直观地显示了赤芍防治肝癌具有多成分、多靶点、多通路的特点,为后续开发治疗肝癌的药物提供了理论基础。
中图分类号: