摘要:
目的:利用网络数据库和生物信息学技术平台,分析脐带间充质干细胞(umbilical cord mesenchymal stem cells,UC-MSCs)治疗乳腺癌疾病(breast cancer,BC)的数据,预测UC-MSCs 治疗乳腺癌的核心靶点。方法:从 NCBI(www.ncbi.com.cn)中的GEO 数据库搜索UC-MSCs 治疗BC 的原始数据集GSE64827,利用R 软件对其数据进行标准化处理得出差异基因。使用STRING 数据库进行蛋白- 蛋白相互作用网络分析和拓扑分析,利
用DAVID 在线工具和R 软件对相关基因进行GO 富集分析和KEGG 通路分析。结果:利用R 软件筛出11 个差异基因,做其蛋白- 蛋白相互作用(置信度大于或等于0.7 的相关基因)网络分析和拓扑分析,提示ALDOC、IGFBP3、DDIT4 和PFKFB4 这4 个基因的关联度较高。GO 分析注释得到了3 条生物过程,分别是果糖代谢过程、糖酵解过程和缺氧反应过程,涉及的主要基因为PFKFB4、ALDOC、DDIT4 和CA9。KEGG 通路分析得到一条果糖和甘露糖代谢通路,涉及基因为ALDOC、PFKFB4。结论:本研究利用网络数据库和生物信息学技术平台预测UC-MSCs 治疗乳腺癌核心靶点有ALDOC、PFKFB4 和DDIT4。
中图分类号:
尤斯涵, 郭春燕. 脐带间充质干细胞治疗乳腺癌核心靶点的预测[J]. 神经药理学报, 2021, 11(6): 17-.
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